Il Museo Civico di Paleontologia e Paletnologia di Maglie, istituito nel 1960 dal Gruppo Speleologico Salentino, ente morale costituito nel 1955 a Maglie, fu riconosciuto con Decreto Interministeriale nel 1965 tra i Musei Minori non Statali.

Fortemente sostenuto dall'Istituto Italiano di Paleontologia Umana, nelle figure di Gian Alberto e Alberto Carlo Blanc, il Museo fu il naturale esito di una lunga attività di ricerca sul territorio, condotta da alcuni appassionati locali e da specialisti italiani, tra cui i Blanc, Antonio Lazzari, Paolo Graziosi, Antonio Mario Radmilli, Giuliano Cremonesi e Decio de Lorentiis che, con carica onorifica, lo ha diretto dal 1970 al 1994.

Dal 1999, la ridefinizione degli spazi espositivi al piano terra del Palazzo Sticchi, in Via Vittorio Emanuele, mira ad esaltare il ruolo di Museo del Territorio che questi studiosi vollero imprimergli fin dalla sua istituzione ed assieme alla Biblioteca Comunale F. Piccinno, costituisce il complesso culturale cittadino denominato L'Alca.